MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018745	AAGTTT	2	12	60	71	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018745	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018745	GTT	2	6	309	314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018745	AATA	2	8	400	407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018745	TAA	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018745	AC	4	8	612	619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018745	TTC	2	6	656	661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018745	AGAT	2	8	679	686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018745	TAA	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018745	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018745	A	7	7	798	804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018745	AAAC	2	8	868	875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018745	A	8	8	892	899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018745	TGAC	2	8	955	962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018745	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018745	TAC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018745	TAG	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018745	ATAA	2	8	1102	1109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018745	T	6	6	1161	1166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018745	TGA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018745	G	6	6	1221	1226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018745	AAAGG	2	10	1249	1258	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018745	TCA	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018745	ATT	3	9	1310	1318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018745	TAA	2	6	1321	1326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018745	ATT	2	6	1847	1852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018745	TTG	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018745	A	7	7	1910	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018745	TAAA	2	8	1924	1931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018745	AATT	2	8	6455	6462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018745	AT	3	6	6463	6468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018745	AGA	2	6	9618	9623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018745	TAAA	2	8	9647	9654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018745	TGG	2	6	9689	9694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018745	A	6	6	9759	9764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018745	ACAA	2	8	9799	9806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018745	A	6	6	12566	12571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018745	A	6	6	12604	12609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018745	ATTGA	2	10	14124	14133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018745	ATT	2	6	14139	14144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018745	TAAATA	2	12	14163	14174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018745	TTATAT	2	12	14188	14199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018745	ATAA	2	8	14209	14216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018745	A	6	6	14363	14368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018745	A	6	6	14377	14382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018745	ACA	2	6	14386	14391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018745	TAGT	2	8	14415	14422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018745	TTAG	2	8	14424	14431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018745	CTT	2	6	14447	14452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018745	TATTTA	2	12	14459	14470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018745	T	7	7	14479	14485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018745	AAT	2	6	14489	14494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018745	CTT	2	6	14544	14549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018745	AAT	2	6	14580	14585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018745	A	8	8	14673	14680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018745	TCT	2	6	14681	14686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018745	GTT	2	6	14765	14770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018745	TA	3	6	14836	14841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018745	TCA	3	9	14878	14886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018745	T	7	7	14897	14903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018745	T	6	6	14931	14936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018745	T	7	7	14938	14944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018745	CGA	2	6	14947	14952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018745	T	7	7	14959	14965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018745	TCA	2	6	14984	14989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018745	ACTA	2	8	14991	14998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018745	TA	3	6	15003	15008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018745	ATA	2	6	15019	15024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018745	T	8	8	15029	15036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018745	CAAAT	2	10	16961	16970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018745	TAC	2	6	18396	18401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018745	A	7	7	18403	18409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018745	A	6	6	18411	18416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018745	TTA	2	6	18417	18422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018745	TTGA	2	8	18486	18493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018745	TA	3	6	18581	18586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018745	AGA	2	6	18591	18596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018745	AGG	2	6	18648	18653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018745	ATT	2	6	18656	18661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018745	A	9	9	18710	18718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018745	CAAAAA	2	12	18732	18743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018745	A	7	7	18739	18745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018745	TGA	2	6	18747	18752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018745	A	7	7	18797	18803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018745	AAT	2	6	18944	18949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018745	AT	3	6	18952	18957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018745	GATA	2	8	19046	19053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018745	A	8	8	19060	19067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018745	GA	3	6	19072	19077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018745	TG	3	6	19757	19762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018745	TAAAA	2	10	19791	19800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018745	GAA	2	6	19806	19811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018745	T	6	6	19858	19863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018745	AAT	2	6	19865	19870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018745	ATTT	2	8	19881	19888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018745	TCT	2	6	19889	19894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018745	TAA	2	6	19898	19903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018745	ATA	2	6	19921	19926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018745	GTTAT	2	10	19970	19979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018745	TAA	2	6	19980	19985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018745	TAA	2	6	19990	19995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018745	AAT	2	6	20008	20013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018745	TATT	2	8	20058	20065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018745	A	7	7	20102	20108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018745	TA	3	6	20110	20115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018745	GAT	2	6	20203	20208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018745	CAT	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018745	AAGA	2	8	20260	20267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018745	CTT	2	6	20281	20286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018745	TACA	2	8	22979	22986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018745	TCAT	2	8	22988	22995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018745	T	7	7	25005	25011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018745	ACA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018745	TAT	2	6	25142	25147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018745	A	6	6	25160	25165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018745	TGA	2	6	25179	25184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018745	AAT	2	6	25256	25261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018745	ATA	2	6	25278	25283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018745	GA	4	8	25309	25316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018745	A	6	6	25350	25355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018745	AT	3	6	25366	25371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018745	GCA	2	6	25381	25386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018745	GTT	2	6	25679	25684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018745	AAT	2	6	25721	25726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018745	AG	3	6	25737	25742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018745	GCTTC	2	10	25823	25832	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018745	GTTTA	2	10	25842	25851	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018745	T	8	8	25865	25872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018745	A	8	8	25876	25883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018745	A	6	6	25897	25902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018745	CA	3	6	25915	25920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018745	TTA	2	6	25941	25946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018745	A	7	7	26070	26076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018745	T	7	7	26094	26100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018745	T	6	6	26138	26143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018745	AAT	3	9	26223	26231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018745	T	8	8	26241	26248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018745	ATT	2	6	28801	28806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018745	TTAA	2	8	28843	28850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018745	GAA	2	6	28856	28861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018745	AAAC	2	8	28862	28869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018745	TATCA	2	10	28906	28915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018745	ATGA	2	8	29363	29370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018745	ATA	2	6	30040	30045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018745	TTGG	2	8	30102	30109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018745	TA	3	6	30150	30155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018745	GAA	2	6	30205	30210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018745	ATA	2	6	30216	30221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018745	ATA	2	6	30245	30250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018745	T	7	7	30251	30257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018745	TAGG	2	8	30275	30282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018745	TCTT	2	8	30306	30313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_018745	ACC	2	6	30325	30330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_018745	CTA	2	6	30356	30361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018745	ATA	2	6	30380	30385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018745	TAT	2	6	30395	30400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018745	ATC	2	6	30417	30422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018745	GCCT	2	8	30423	30430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_018745	AAT	2	6	30444	30449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018745	TCG	2	6	30454	30459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018745	A	6	6	32994	32999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018745	TTC	2	6	33004	33009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_018745	ATA	2	6	34022	34027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018745	TAG	2	6	34034	34039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.